根据感染部位可以分为上呼吸道感染和下呼吸道感染。上呼吸道感染的病原体大部分为病毒，细菌占比很少。下呼吸道感染是最常见的感染性疾病，包括急慢性支气管炎、肺部感染等，以革兰氏阳性球菌为主（主要为肺炎球菌），其次为革兰氏阴性杆菌。

无论是病毒引起的，还是细菌引起的疾病，都需要选用恰当的抗生素。抗生素首选阿莫西林克拉维酸钾（莫比新），治疗下呼吸道感染也可考虑二代头孢菌素。若有混合厌氧菌感染，可加用甲硝唑（硝复乐）或克林霉素。

β-内酰胺类抗生素在治疗呼吸道感染中应用最为广泛！

主要包括青霉素类、头孢菌素类。β-内酰胺类抗生素与β-内酰胺酶抑制剂（克拉维酸钾）合用可明显增加抗菌活性并减少耐药菌株的产生。

因肠道末端连接十二指肠，故致病菌与肠道菌群基本一致，以大肠杆菌为主，其次为假单胞菌、肠球菌、变形杆菌，且常为两种以上的混合感染。厌氧菌感染率比其他部位高。

选用抗生素时应考虑致病菌种、细菌耐药性、抗生素的抗菌谱。在得到药敏试验结果之前，要选择具有强大抑菌或杀菌力、不良反应小的药物。头孢菌素类和甲硝唑（硝复乐）都是常用药物。

头孢菌素类

第一代头孢主要对革兰氏阳性球菌有效，故肠球菌感染时可用头孢氨苄（宠立维）。二代头孢对部分革兰氏阴性杆菌及革兰氏阳性球菌有效，头孢呋肟、头孢羟唑的胆道浓度高于血清浓度，可用于胆系感染，但对绿脓杆菌无效。三代头孢对革兰氏阴性杆菌、绿脓杆菌有强大杀菌能力，且肾毒性低，但对革兰氏阳性球菌不如第一、二代。

泌尿系统感染的发病率仅次于呼吸系统，85%的尿路感染为大肠杆菌所致，其次为副大肠杆菌、绿脓杆菌、变形杆菌、厌氧杆菌及葡萄球菌等。可经验治疗给予喹诺酮类药物——恩诺沙星（宠艾诺），治疗3天后若病情没有改善则根据药敏结果换药（用药前应先行尿液培养及药敏试验）。要尽可能选用肾毒性小、不良反应少、服用方便、细菌不易产生耐药性的抗生素，并尽可能单一用药。

骨科感染性疾病主要有急慢性骨髓炎、化脓性关节炎及硬化性骨髓炎。其致病菌主要为假单胞菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、溶血链球菌及变形杆菌。在治疗骨和关节感染时，宜选用在骨组织和关节腔中能够达有效浓度、细菌不易产生耐药性及毒副作用少的药物。青霉素、林可霉素、克林霉素、头孢菌素等易进入关节腔，故宜于使用。

皮肤软组织与外界的各种病原体直接接触，并且受到外伤的机会远远高于其他各系统及器官。其致病菌主要为中间葡萄球菌、溶血链球菌。治疗首选头孢氨苄（宠立维）。